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新算法将基因测序速度提升5倍

2020-06-29 09: 25    来源:中国科学报    作者:冯丽妃 王方

中国农业科学院农业基因组研究所阮珏团队在《自然—方法学》上发表第三代测序数据组装算法wtdbg。该算法极大地提高了三代基因测序数据的分析效率。

实验证实,与2019年4月1日发表在《自然—生物技术》上的Flye算法相比,该算法分析速度提升了5倍,并首次将测序数据分析时间降低到少于测序数据产出时间,同时实现了相当的连续性和准确性。它代表了算法上的重大进步,并为将来群体规模的组装分析铺平道路。

点评:基因组学技术飞速进步既源于测序技术的发展,也依赖于数据分析技术的提高。wtdbg和即将推出的工具可能会从根本上改变当前测序数据分析的实践。

编辑:姚朝晖